Revue PacBio

Le système Revio ajoute un prix abordable, un débit élevé et une facilité d'utilisation à une base de lectures longues, une précision exceptionnelle et une détection directe de la méthylation.

Avec une cellule SMRT haute densité de 25 millions de ZMW, jusqu'à 4 cellules SMRT en parallèle et des durées d'exécution de 24 heures, le système Revio fournit 360 Go de lectures HiFi par jour, ce qui équivaut à 1 300 génomes humains entiers par an.​

Le séquençage HiFi fournit de petites variantes, des variantes structurelles, des expansions répétées, une méthylation et une mise en phase d'haplotype à partir d'une seule bibliothèque et d'une seule analyse de séquençage.​

Le fonctionnement du système Revio est simple, grâce à une combinaison de réactifs et de plaques d'échantillons, à une configuration rapide des analyses, à la flexibilité de mettre les analyses en file d'attente pendant que le séquençage est en cours et à l'absence d'alimentation externe en azote.​

Les algorithmes avancés du système Revio offrent une précision de lecture exceptionnelle ainsi qu'un appel de méthylation à chaque exécution. Ses formats de fichiers optimisés réduisent les besoins de stockage de données grâce à un regroupement de valeurs de qualité et à un ordre de lecture intelligent.

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Avec le système Revio, vous pouvez atteindre un débit plus élevé pour prendre en charge des études de grande envergure et développer de nouvelles applications. Le système Revio peut générer1 300 équivalents de génome humainpar an,15× plusque le système Sequel IIe, via :

Primé

Le séquençage à lecture longue, exceptionnellement précis et à haut débit, à grande échelle mérite d’être célébré !

Les MedTech Breakthrough Awards récompensent aujourd'hui les meilleures entreprises, personnes, plateformes et produits des secteurs de la santé, du fitness et de la technologie médicale.

Le système Revio simplifie l'expérience de séquençage HiFi avec moins de consommables optimisés pour un suivi facile et un gaspillage minimal. Grâce aux améliorations du flux de travail, le chargement des consommables prend moins d'une minute sur l'instrument.

Le kit polymérase contient des réactifs optimisés pour lier la polymérase à 24 bibliothèques SMRTbell en préparation pour le séquençage.

Un plateau contient 4 cellules SMRT haute densité, chacune avec 25 millions de guides d'ondes en mode zéro.

La plaque de séquençage fournit des réactifs pour séquencer jusqu'à 4 cellules Revio SMRT et combine plusieurs éléments du système Sequel IIe : plaque de séquençage, plaque d'échantillon, plaque de mélange et huile cellulaire SMRT.

Le système Revio vous offre une expérience considérablement simplifiée avec des consommables et des logiciels conçus pour être flexibles et pratiques. Que vous soyez un centre de génomique ou un petit laboratoire, vous pouvez profiter de :

La préparation de bibliothèque pour le système Revio prend en charge les préparations manuelles et automatisées avec le kit de préparation SMRTbell 3.0.

Les plaques de séquençage sont automatiquement liées pour analyser les conceptions via une étiquette NFC, ce qui permet de configurer les analyses en moins d'une minute sur l'instrument.

La plate-forme de travail Revio est isolée des quatre étapes de séquençage, laissant le système disponible jusqu'à 20 heures par jour pour charger les consommables pour les exécutions ultérieures.

Le système Revio comprend de puissants GPU NVIDIA, qui fournissent plus de 20 fois la puissance de calcul du système Sequel IIe, pour fournir des données précises et prêtes à l'emploi directement depuis l'instrument.​

Les GPU offrent un délai d'exécution rapide pour les appels de base et la génération de lectures HiFi, produisant directement des lectures HiFi au format BAM.

DeepConsensus utilise des techniques avancées d'apprentissage en profondeur pour étendre davantage la précision et le rendement du séquençage HiFi.

Les analyses standard incluent l’état de méthylation de l’ADN, calculé avec un algorithme d’apprentissage en profondeur qui traite la cinétique de la polymérase.